229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0279 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  36.33 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  37.55 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  35.1 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 342 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.8 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  32.42 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.64 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  31.7 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 343 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  28.63 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  33.11 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.56 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.5 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  27.4 
 
 		 226 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  30.94 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>