50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5023 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  100 
 
 
238 aa  488  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  42.17 
 
 
245 aa  136  3e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  35.45 
 
 
225 aa  132  4e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  31.38 
 
 
239 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  30.96 
 
 
239 aa  119  5e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  32.58 
 
 
223 aa  119  5e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  33.48 
 
 
228 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  31.19 
 
 
251 aa  115  4e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  31.76 
 
 
251 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  30.94 
 
 
225 aa  112  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  31.82 
 
 
223 aa  111  1e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  33.8 
 
 
231 aa  108  9e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  29.91 
 
 
283 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  29.28 
 
 
223 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  29.61 
 
 
238 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  32.84 
 
 
202 aa  102  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  32.42 
 
 
223 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  30.7 
 
 
229 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  33.33 
 
 
230 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  32.89 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  30.52 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  28.37 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  29.2 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  27.01 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  28.04 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  27.73 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  28.42 
 
 
234 aa  85.9  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  29.28 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  27.7 
 
 
231 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  26.85 
 
 
228 aa  84.7  1e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  26.82 
 
 
237 aa  83.2  4e-15  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  28.18 
 
 
239 aa  81.6  9e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  30.85 
 
 
226 aa  78.2  1e-13  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  27.57 
 
 
234 aa  75.5  6e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  27.57 
 
 
234 aa  75.5  6e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  26.51 
 
 
290 aa  73.6  2e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  25.11 
 
 
227 aa  73.6  3e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  26.09 
 
 
215 aa  72.4  6e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  26.64 
 
 
234 aa  72.4  6e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  25 
 
 
351 aa  59.7  3e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  24.43 
 
 
228 aa  59.3  5e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  24.52 
 
 
233 aa  52.4  7e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  26.24 
 
 
244 aa  51.2  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  22.55 
 
 
225 aa  50.4  2e-05  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  25.49 
 
 
225 aa  50.1  3e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  23.81 
 
 
237 aa  50.1  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7350  Type IV secretory pathway component VirB8 protein-like protein  23.32 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.160326 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  25.32 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0158  hypothetical protein  37.31 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0176  hypothetical protein  37.31 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>