More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4013 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
391 aa  788  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  31.56 
 
 
368 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  31.94 
 
 
368 aa  123  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 
400 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.94 
 
 
405 aa  121  2e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
412 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 
405 aa  120  4e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
415 aa  120  5e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
404 aa  120  5e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
379 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
394 aa  118  2e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
379 aa  115  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.18039e-13 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
403 aa  114  2e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
368 aa  114  2e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  29.39 
 
 
402 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
399 aa  112  8e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  4.95341e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 
379 aa  112  1e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.01 
 
 
380 aa  109  9e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
412 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
373 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 
379 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
376 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.72 
 
 
378 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
380 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
373 aa  106  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
373 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
392 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
380 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
381 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 
384 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
373 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1027  extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
384 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  2.99575e-07  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 
389 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
406 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 
381 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
379 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 
400 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  32.91 
 
 
402 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
400 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3686  extracellular ligand-binding receptor  28.66 
 
 
383 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
371 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  8.9327e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 
387 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 
392 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 
386 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 
401 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  26.9 
 
 
393 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
382 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1977  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.95 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
379 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
381 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
395 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1959  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.95 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  26.95 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 
417 aa  96.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
401 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 
374 aa  96.7  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  31.74 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  28.29 
 
 
383 aa  96.3  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
397 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0253  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.42 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.42 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.42 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.42 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  25.49 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  30.58 
 
 
416 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 
379 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.96452e-13 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64326e-10 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19526e-06 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0997  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.19 
 
 
392 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489385  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  34.63 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1054  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.145597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  33.08 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6118  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  29.27 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.48 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.48 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1695  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 
372 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
393 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>