More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0020 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0020  thymidylate kinase  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  39.53 
 
 
213 aa  132  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  37.85 
 
 
206 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf161  thymidylate kinase  34.91 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.403235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  32.72 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.4 
 
 
233 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  34.78 
 
 
211 aa  125  7e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  35.48 
 
 
217 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  32.37 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  34.88 
 
 
211 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  31.37 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  34.43 
 
 
214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  34.29 
 
 
205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  32.51 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  33.67 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  34.74 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  33.02 
 
 
215 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  33.66 
 
 
207 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  36.1 
 
 
213 aa  115  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  36.1 
 
 
211 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  31.53 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  31.1 
 
 
209 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  31.53 
 
 
217 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  31.73 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  33.33 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  30.66 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  32.21 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  32.26 
 
 
214 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  31.6 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  37.44 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  33.62 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  32.55 
 
 
213 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  35.82 
 
 
213 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  32.86 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  32.09 
 
 
230 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  30.52 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  34.93 
 
 
203 aa  111  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  31.71 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1962  thymidylate kinase  32 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  31.53 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  31.92 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  32.55 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  31.75 
 
 
705 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  31.48 
 
 
211 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  30.7 
 
 
686 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  31.31 
 
 
686 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  32.34 
 
 
216 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  32.57 
 
 
222 aa  109  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  36.2 
 
 
206 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  34.8 
 
 
209 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  31.75 
 
 
703 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  32.41 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  29.5 
 
 
236 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  31.65 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  29.38 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  30.48 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  31.46 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  29.81 
 
 
215 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  32.2 
 
 
207 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  29.21 
 
 
244 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  30.84 
 
 
221 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  29.74 
 
 
244 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  33.04 
 
 
230 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  33.85 
 
 
230 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  30 
 
 
217 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  33.68 
 
 
210 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  35.48 
 
 
209 aa  105  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  31.03 
 
 
219 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  30.43 
 
 
234 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  32.14 
 
 
205 aa  104  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  37.74 
 
 
216 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  31.5 
 
 
205 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  30.39 
 
 
200 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  36 
 
 
212 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  30.05 
 
 
203 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  33.33 
 
 
212 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  29.82 
 
 
218 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  32.14 
 
 
206 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  32.67 
 
 
210 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  30.41 
 
 
226 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  31.92 
 
 
212 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  28.93 
 
 
211 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  31.34 
 
 
206 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  27.64 
 
 
226 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  33.51 
 
 
210 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33.79 
 
 
212 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  30.88 
 
 
207 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  33.51 
 
 
210 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  34 
 
 
204 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  30.29 
 
 
215 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  27.5 
 
 
240 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  29.72 
 
 
207 aa  101  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  33.02 
 
 
199 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  30.84 
 
 
210 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1536  dTMP kinase  26.82 
 
 
237 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  30.19 
 
 
217 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  31.16 
 
 
212 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  29.72 
 
 
215 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  32.14 
 
 
197 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  28.97 
 
 
209 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>