More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1962 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1962  thymidylate kinase  100 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.113486  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 222 aa  154  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  43.01 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 217 aa  148  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  47.4 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  45.9 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  45 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  38.1 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40.88 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.21 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  46.11 
 
 		 232 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  35.33 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  48.11 
 
 		 217 aa  140  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.41 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  48.92 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.65 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  36.49 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45.11 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.41 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  40.41 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43 
 
 		 901 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  42.5 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  38.5 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  37.76 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  45.21 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  35.61 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  40.2 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  38.8 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  38.8 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  36.59 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  41.21 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  38.27 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  45.83 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  40.56 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  38.16 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  38 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43 
 
 		 686 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  37.77 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  39.7 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  38.51 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  45.92 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  44.51 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.76 
 
 		 233 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 244 aa  128  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.07 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 686 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  38.25 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  45.41 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.27 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  37 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  35.83 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  35.86 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  35.29 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  43.88 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  36.41 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  45.31 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 295 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  37.17 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  41.58 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  41.11 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.11 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  40.21 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  37.63 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  45.51 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 215 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  42.47 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  40.32 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  38.42 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  42.45 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 707 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0460  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  44.51 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  41.98 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  38.34 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  42.51 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  35.91 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>