More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1017 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  100 
 
 
643 aa  1297    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  45.63 
 
 
311 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  47.91 
 
 
311 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  37.42 
 
 
311 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  40.13 
 
 
309 aa  184  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  38.05 
 
 
310 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  38.69 
 
 
309 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  53.33 
 
 
301 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  34.31 
 
 
317 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  41.8 
 
 
307 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  42.35 
 
 
312 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  43.83 
 
 
304 aa  145  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  39.3 
 
 
323 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  32.12 
 
 
304 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  43.02 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  34.93 
 
 
315 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  41.99 
 
 
313 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  34.58 
 
 
293 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  41.92 
 
 
313 aa  140  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  42.77 
 
 
302 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  46.86 
 
 
316 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  32.46 
 
 
291 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  38.25 
 
 
320 aa  139  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  40.88 
 
 
314 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  35.93 
 
 
326 aa  135  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  39.38 
 
 
324 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  38.75 
 
 
319 aa  134  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  39.06 
 
 
305 aa  134  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  39.05 
 
 
318 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  38.41 
 
 
294 aa  131  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  42.53 
 
 
296 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  42.53 
 
 
319 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  42.53 
 
 
319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  36.21 
 
 
287 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  42.53 
 
 
319 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  39.77 
 
 
295 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  38.95 
 
 
323 aa  127  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  34.55 
 
 
292 aa  127  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  35.68 
 
 
294 aa  127  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  31.37 
 
 
313 aa  127  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  39.88 
 
 
302 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  40 
 
 
302 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  35.86 
 
 
287 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  33.97 
 
 
315 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  42.51 
 
 
312 aa  125  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  40 
 
 
314 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  37.5 
 
 
313 aa  124  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  36.4 
 
 
287 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  28.77 
 
 
294 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  36.07 
 
 
319 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  37.72 
 
 
323 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  38.1 
 
 
301 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  38.65 
 
 
313 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  39.66 
 
 
306 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  33.86 
 
 
301 aa  117  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  41.72 
 
 
292 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  39.05 
 
 
306 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  37.5 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  31.3 
 
 
331 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  31.58 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  35.63 
 
 
299 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  39.52 
 
 
293 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  27.95 
 
 
295 aa  114  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  34.13 
 
 
326 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  32.42 
 
 
326 aa  112  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  39.9 
 
 
324 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  39.9 
 
 
324 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  39.9 
 
 
324 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  30.36 
 
 
288 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  39.38 
 
 
324 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  30.7 
 
 
326 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  30.91 
 
 
321 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  30.7 
 
 
326 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  33.91 
 
 
323 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  39.56 
 
 
323 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  38.74 
 
 
324 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  29.74 
 
 
320 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  37.95 
 
 
293 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  30.5 
 
 
335 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  33.52 
 
 
296 aa  106  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  33.17 
 
 
321 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  28.53 
 
 
330 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  33.96 
 
 
326 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  30.27 
 
 
328 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  29.63 
 
 
329 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  28.82 
 
 
324 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  26.3 
 
 
579 aa  97.8  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  42.77 
 
 
323 aa  97.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  33.93 
 
 
331 aa  97.1  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  33.79 
 
 
307 aa  97.1  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  30.54 
 
 
321 aa  97.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  33.15 
 
 
303 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  34.18 
 
 
298 aa  95.1  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  32.5 
 
 
322 aa  94.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  34.67 
 
 
347 aa  94  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  28.29 
 
 
324 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  33.48 
 
 
273 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  28.81 
 
 
324 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  27.03 
 
 
323 aa  93.6  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  30.22 
 
 
321 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>