More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1107 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  100 
 
 
308 aa  628  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  99.68 
 
 
308 aa  627  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  60.34 
 
 
309 aa  371  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  56.55 
 
 
331 aa  349  4e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  52.9 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  44.04 
 
 
388 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  41.69 
 
 
405 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  42.86 
 
 
359 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  45.15 
 
 
361 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  43.48 
 
 
413 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  40.68 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  43.23 
 
 
378 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  40.61 
 
 
360 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  38.44 
 
 
387 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  42.75 
 
 
436 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  40.55 
 
 
386 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  39.25 
 
 
367 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  39.78 
 
 
389 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.11 
 
 
503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  39.22 
 
 
350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  39.22 
 
 
350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  34.55 
 
 
393 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  36.7 
 
 
403 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  37.12 
 
 
406 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  37.63 
 
 
385 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  40.22 
 
 
378 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  36.96 
 
 
350 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.96 
 
 
433 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  37.97 
 
 
383 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  36.64 
 
 
399 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.6 
 
 
395 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  36.45 
 
 
385 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.97 
 
 
395 aa  205  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  37.41 
 
 
398 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  38.04 
 
 
498 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  37.83 
 
 
368 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  37.99 
 
 
378 aa  203  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  38.38 
 
 
389 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  38.03 
 
 
390 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  40.07 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  36.81 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  35.9 
 
 
357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  35.16 
 
 
347 aa  200  3e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  38.1 
 
 
383 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  39.49 
 
 
391 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1332  hflK protein, putative  36.75 
 
 
318 aa  198  7.999999999999999e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.683912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  36.95 
 
 
379 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  35.08 
 
 
382 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  36.33 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  34.81 
 
 
465 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  38.49 
 
 
394 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  37.91 
 
 
333 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  36.99 
 
 
477 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  37.5 
 
 
475 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  38.1 
 
 
474 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  35.43 
 
 
386 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  35.2 
 
 
464 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  36.36 
 
 
359 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  38.18 
 
 
471 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  34.88 
 
 
447 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  33.62 
 
 
459 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  39.25 
 
 
389 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  34.87 
 
 
383 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  35.35 
 
 
386 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  36.27 
 
 
464 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.74 
 
 
452 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  34.9 
 
 
435 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  37.23 
 
 
382 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  34 
 
 
386 aa  187  1e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  37.23 
 
 
382 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  33.68 
 
 
376 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  36.18 
 
 
456 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.45 
 
 
451 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.45 
 
 
451 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  39.01 
 
 
447 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.23 
 
 
381 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  36.68 
 
 
362 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  37.09 
 
 
471 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  34.54 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  35.06 
 
 
395 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  35.06 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  36.04 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  35.84 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  34.69 
 
 
401 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  34.54 
 
 
382 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  34.45 
 
 
418 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.22 
 
 
420 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  37.74 
 
 
329 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  33.67 
 
 
453 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  33.67 
 
 
441 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  36.07 
 
 
357 aa  181  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  34.68 
 
 
386 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  35.49 
 
 
437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  35.49 
 
 
454 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  35.49 
 
 
437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  35.49 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  35.49 
 
 
449 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  36.36 
 
 
394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  35.49 
 
 
437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  34.23 
 
 
381 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>