91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0210 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
609 aa  1241    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 
606 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 
1187 aa  169  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  27.17 
 
 
902 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  27.84 
 
 
577 aa  94  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 
1162 aa  94  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  25.57 
 
 
580 aa  81.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  26.42 
 
 
794 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  25.19 
 
 
749 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  24.87 
 
 
749 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  25.69 
 
 
744 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  25.75 
 
 
747 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 
744 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  26.01 
 
 
728 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
734 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 
811 aa  73.9  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 
732 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  26.33 
 
 
743 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  26.7 
 
 
674 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  26.18 
 
 
807 aa  72.8  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  28.45 
 
 
726 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 
580 aa  71.2  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  27.61 
 
 
729 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  26.62 
 
 
1042 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  28.17 
 
 
726 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  24.77 
 
 
728 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  24.7 
 
 
566 aa  68.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  25.46 
 
 
574 aa  68.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 
811 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
726 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 
575 aa  67.8  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 
570 aa  67.4  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  25.91 
 
 
729 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 
584 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
722 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 
731 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
1022 aa  65.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  24.71 
 
 
814 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  26.73 
 
 
568 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  26.73 
 
 
568 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  24.35 
 
 
814 aa  64.7  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 
817 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
791 aa  63.9  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  23.86 
 
 
811 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 
807 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 
820 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 
551 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  23.91 
 
 
672 aa  62  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  23.85 
 
 
812 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 
566 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
850 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  23.14 
 
 
813 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 
786 aa  60.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  26.49 
 
 
686 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  24.88 
 
 
829 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  27.27 
 
 
766 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
1000 aa  58.5  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  25.81 
 
 
695 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
598 aa  57.4  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  24.04 
 
 
706 aa  57.4  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
994 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 
1006 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  24.15 
 
 
672 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  24.15 
 
 
672 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 
485 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 
779 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  24.05 
 
 
677 aa  53.9  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 
511 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 
485 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  22.82 
 
 
736 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 
471 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 
472 aa  51.6  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  22.29 
 
 
759 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  23.96 
 
 
407 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  25.75 
 
 
709 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0583  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 
657 aa  49.7  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 
582 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  26.07 
 
 
821 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  24.7 
 
 
520 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13047  hypothetical protein  29.23 
 
 
526 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  25.33 
 
 
520 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 
823 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 
521 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 
521 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 
521 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  26.86 
 
 
514 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4261  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
531 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  20.51 
 
 
790 aa  44.3  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  22.73 
 
 
457 aa  44.3  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2097  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 
532 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 
394 aa  43.5  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>