43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0038 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  46.5 
 
 		 794 aa  721    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  48.81 
 
 		 813 aa  786    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  50.06 
 
 		 811 aa  810    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  43.99 
 
 		 786 aa  686    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  48.76 
 
 		 811 aa  805    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  45.1 
 
 		 814 aa  750    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  48.69 
 
 		 812 aa  810    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  44.85 
 
 		 814 aa  730    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  48.19 
 
 		 817 aa  768    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  51.24 
 
 		 807 aa  849    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  49.29 
 
 		 820 aa  784    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 		 850 aa  752    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  50.12 
 
 		 811 aa  830    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 		 807 aa  1666    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  43.84 
 
 		 791 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  43.56 
 
 		 823 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  42.88 
 
 		 812 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  40.07 
 
 		 862 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  42.75 
 
 		 816 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  44.03 
 
 		 900 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  42.88 
 
 		 812 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  40.15 
 
 		 871 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  39.07 
 
 		 907 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  38.98 
 
 		 902 aa  554  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  38.52 
 
 		 790 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  45.84 
 
 		 709 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  42.04 
 
 		 779 aa  436  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  45.38 
 
 		 821 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  46.4 
 
 		 771 aa  416  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  39.41 
 
 		 766 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  36.97 
 
 		 682 aa  291  4e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  38.23 
 
 		 485 aa  280  8e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 485 aa  267  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 472 aa  262  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  35.97 
 
 		 471 aa  258  3e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 609 aa  72.8  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  32.28 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  24.77 
 
 		 686 aa  57.4  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 1162 aa  52  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 732 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  20.5 
 
 		 1042 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  27.98 
 
 		 574 aa  45.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 1022 aa  44.7  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>