21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2840 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  100 
 
 		 672 aa  1394    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0583  glycoside hydrolase family protein  52.3 
 
 		 657 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 		 672 aa  1394    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  53.23 
 
 		 677 aa  688    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  39.26 
 
 		 672 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  33.78 
 
 		 686 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  32.42 
 
 		 736 aa  332  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  33.82 
 
 		 706 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0802  4-alpha-glucanotransferase  37.26 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0708796  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1395  glycosy hydrolase family protein  32.26 
 
 		 627 aa  91.3  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 		 609 aa  55.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0448  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 659 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  24.38 
 
 		 361 aa  48.5  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 		 1162 aa  47.4  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1116  alpha amylase domain-containing protein  24.39 
 
 		 654 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  27.22 
 
 		 407 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1400  glycoside hydrolase family 57  22.22 
 
 		 633 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0415  alpha amylase domain-containing protein  26.23 
 
 		 663 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  26.73 
 
 		 529 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  29.59 
 
 		 533 aa  43.9  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>