13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1116 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1116  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 654 aa  1360    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0448  glycoside hydrolase family protein  52.66 
 
 		 659 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0415  alpha amylase domain-containing protein  43.12 
 
 		 663 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3268  alpha amylase domain-containing protein  38.72 
 
 		 638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1400  glycoside hydrolase family 57  39.65 
 
 		 633 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2964  glycoside hydrolase family protein  37.72 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  28.57 
 
 		 677 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  22.35 
 
 		 686 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  26.02 
 
 		 672 aa  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  24.39 
 
 		 672 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  24.39 
 
 		 672 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  20.86 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  22.15 
 
 		 407 aa  43.9  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>