28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0998 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
672 aa  1360    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  35.66 
 
 
677 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  39.26 
 
 
672 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  39.26 
 
 
672 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0583  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 
657 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  37.56 
 
 
686 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  36.26 
 
 
706 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0802  4-alpha-glucanotransferase  37.92 
 
 
588 aa  355  1e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0708796  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  31.65 
 
 
736 aa  355  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 
598 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1395  glycosy hydrolase family protein  26.32 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 
609 aa  62  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  21.76 
 
 
457 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  23.28 
 
 
457 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 
485 aa  52  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  24.24 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  27.59 
 
 
870 aa  51.2  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  19.93 
 
 
456 aa  51.2  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1116  alpha amylase domain-containing protein  26.02 
 
 
654 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 
394 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  22.76 
 
 
395 aa  47.8  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  25.69 
 
 
428 aa  47.8  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  23.98 
 
 
447 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  25.99 
 
 
533 aa  45.8  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0448  glycoside hydrolase family protein  20.63 
 
 
659 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 
472 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  27.13 
 
 
361 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 
1187 aa  43.9  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>