40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0969 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  80.62 
 
 
457 aa  768    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  86.43 
 
 
457 aa  841    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  78.73 
 
 
456 aa  776    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  100 
 
 
457 aa  935    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  51.57 
 
 
518 aa  390  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  45.57 
 
 
495 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  45.34 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  45.3 
 
 
484 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  45.48 
 
 
448 aa  308  9e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  42.09 
 
 
398 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  42.86 
 
 
484 aa  300  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  40.51 
 
 
407 aa  296  6e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  40.36 
 
 
407 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  40.2 
 
 
407 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  40.46 
 
 
407 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  43.09 
 
 
444 aa  290  3e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  38.19 
 
 
580 aa  274  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  41.12 
 
 
447 aa  272  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  38.48 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  37.53 
 
 
428 aa  262  8e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  35.62 
 
 
487 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  35.4 
 
 
416 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  31.39 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  28.95 
 
 
490 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  30.28 
 
 
378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  23.28 
 
 
672 aa  55.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 
732 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  24.42 
 
 
743 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  29.66 
 
 
749 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  29.66 
 
 
749 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.52 
 
 
1162 aa  46.6  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 
580 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0448  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 
659 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 
744 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 
609 aa  44.3  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  23.83 
 
 
744 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  28.83 
 
 
598 aa  43.9  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0802  4-alpha-glucanotransferase  22.98 
 
 
588 aa  43.5  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0708796  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 
994 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>