46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2734 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
394 aa  819    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  63.32 
 
 
407 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2345  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  23.35 
 
 
1042 aa  84  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2119  hypothetical protein  25.48 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0970  hypothetical protein  27.52 
 
 
493 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0360823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  21.36 
 
 
744 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2911  hypothetical protein  24.93 
 
 
490 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1962  hypothetical protein  26.06 
 
 
500 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 
1162 aa  60.1  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  20.99 
 
 
744 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1071  hypothetical protein  28.44 
 
 
486 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11021  hypothetical protein  24.29 
 
 
489 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.879161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1131  hypothetical protein  24.53 
 
 
495 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2966  hypothetical protein  27.62 
 
 
495 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  21.7 
 
 
743 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  21.5 
 
 
686 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  29.27 
 
 
736 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 
1000 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  24.15 
 
 
829 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 
994 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 
1022 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4810  hypothetical protein  24.22 
 
 
446 aa  50.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  23.03 
 
 
749 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  23.03 
 
 
749 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0324  hypothetical protein  25.49 
 
 
496 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.430404  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0317  hypothetical protein  25.49 
 
 
496 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  25.52 
 
 
672 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 
1006 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 
566 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 
1187 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  20.88 
 
 
747 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1395  glycosy hydrolase family protein  27.93 
 
 
627 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  28.15 
 
 
902 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12151  hypothetical protein  22.98 
 
 
489 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
485 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0492  hypothetical protein  23.53 
 
 
489 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  24.69 
 
 
706 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 
598 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0802  4-alpha-glucanotransferase  20.75 
 
 
588 aa  43.9  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0708796  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 
582 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 
609 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 
722 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  25.55 
 
 
726 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 
726 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 
471 aa  42.7  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>