29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1919 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  100 
 
 
736 aa  1530    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  34.5 
 
 
686 aa  438  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  32.33 
 
 
706 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  34.04 
 
 
677 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  31.65 
 
 
672 aa  360  6e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0583  glycoside hydrolase family protein  34.64 
 
 
657 aa  353  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  32.61 
 
 
672 aa  332  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  32.61 
 
 
672 aa  332  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0802  4-alpha-glucanotransferase  28.8 
 
 
588 aa  288  2e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0708796  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 
598 aa  219  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1395  glycosy hydrolase family protein  28.95 
 
 
627 aa  69.7  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  28.66 
 
 
407 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  31.63 
 
 
1059 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  28.23 
 
 
1040 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  25.19 
 
 
1034 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 
472 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  22.82 
 
 
609 aa  53.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 
394 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  23.66 
 
 
1034 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 
1058 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  21.48 
 
 
1187 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  23.61 
 
 
870 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 
1022 aa  45.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  21 
 
 
1095 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  26.35 
 
 
1062 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 
471 aa  45.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
485 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1269  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 
1113 aa  44.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 
1162 aa  44.3  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>