65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0672 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  77.73 
 
 		 485 aa  767    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 485 aa  990    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  78.71 
 
 		 471 aa  765    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  76.45 
 
 		 472 aa  770    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 811 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  38.59 
 
 		 811 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  40.18 
 
 		 813 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  38.51 
 
 		 812 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 820 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  36.26 
 
 		 814 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  37.04 
 
 		 807 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  38.25 
 
 		 811 aa  267  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  36.08 
 
 		 814 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  37.69 
 
 		 823 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  37.98 
 
 		 709 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 		 807 aa  259  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 		 786 aa  259  9e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  36.15 
 
 		 871 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  37.25 
 
 		 812 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  37.47 
 
 		 812 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 		 817 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  37.92 
 
 		 816 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 		 850 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  35.12 
 
 		 771 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  38.52 
 
 		 794 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  40.16 
 
 		 779 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  35.16 
 
 		 900 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  36.29 
 
 		 791 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  34.63 
 
 		 790 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  35.92 
 
 		 821 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  36.13 
 
 		 682 aa  227  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  35 
 
 		 862 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 		 907 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  33.1 
 
 		 766 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  34.59 
 
 		 902 aa  216  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 1162 aa  72.8  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 1000 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 		 994 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  26.6 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 1006 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 606 aa  56.6  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 		 1022 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  29.75 
 
 		 902 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  25.72 
 
 		 577 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 609 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  28.47 
 
 		 672 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  28.32 
 
 		 686 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 726 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  26.92 
 
 		 726 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  26.92 
 
 		 726 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 732 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  22.28 
 
 		 674 aa  47  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 731 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 722 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  33.67 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  27.73 
 
 		 520 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  25.27 
 
 		 580 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  26.15 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  34.72 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  26.14 
 
 		 736 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  25.58 
 
 		 729 aa  44.3  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  25.68 
 
 		 456 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2964  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 		 640 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  26.32 
 
 		 728 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  26.82 
 
 		 729 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>