49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0932 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1187 aa  2422    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 606 aa  214  7e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 		 609 aa  170  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  29.83 
 
 		 902 aa  151  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 1162 aa  95.1  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  25.53 
 
 		 744 aa  94  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 744 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  24.76 
 
 		 749 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  24.76 
 
 		 749 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 1022 aa  80.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 1006 aa  78.2  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  23.89 
 
 		 728 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  26.02 
 
 		 728 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 731 aa  75.1  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  27.14 
 
 		 829 aa  75.1  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  25.09 
 
 		 729 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 734 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 		 994 aa  73.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 		 1000 aa  72.8  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 		 732 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  23.51 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  23.78 
 
 		 1042 aa  68.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  24.46 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  25.09 
 
 		 580 aa  68.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  25 
 
 		 695 aa  68.2  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  24.34 
 
 		 674 aa  67.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  26.64 
 
 		 574 aa  67.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  27.66 
 
 		 568 aa  67  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 575 aa  67  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  27.66 
 
 		 568 aa  67  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  26.07 
 
 		 577 aa  65.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  22.6 
 
 		 747 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  24.91 
 
 		 566 aa  62.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  24.54 
 
 		 570 aa  61.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 580 aa  60.1  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 722 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  25.89 
 
 		 706 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 566 aa  55.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 		 584 aa  55.5  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 551 aa  51.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 759 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  26.67 
 
 		 766 aa  50.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 		 394 aa  47.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 		 598 aa  47.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  22.7 
 
 		 823 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  21.74 
 
 		 736 aa  46.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  29.5 
 
 		 677 aa  46.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  27.04 
 
 		 531 aa  45.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>