46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0791 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
598 aa  1207    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  29.37 
 
 
686 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  32.16 
 
 
736 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  25.51 
 
 
672 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1370  4-alpha-glucanotransferase  33.96 
 
 
677 aa  209  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  28.03 
 
 
706 aa  206  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0802  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 
588 aa  204  3e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0708796  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2840  glycosyl hydrolase, family 57  30.28 
 
 
672 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2461  4-alpha-glucanotransferase  30.28 
 
 
672 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0583  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 
657 aa  187  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1395  glycosy hydrolase family protein  23.2 
 
 
627 aa  84  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
609 aa  57.4  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  29.41 
 
 
361 aa  53.5  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  23.15 
 
 
994 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  36.92 
 
 
1046 aa  49.7  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  26.88 
 
 
1048 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  24.49 
 
 
870 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 
1162 aa  48.9  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  27.06 
 
 
1044 aa  48.9  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  35.71 
 
 
520 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 
1006 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
1058 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 
1000 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 
1187 aa  47.4  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  33.71 
 
 
1465 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 
1022 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  34.52 
 
 
511 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  27.98 
 
 
812 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 
820 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  27.98 
 
 
812 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  27.59 
 
 
958 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  26.56 
 
 
533 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0415  alpha amylase domain-containing protein  25.7 
 
 
663 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  28.74 
 
 
1039 aa  45.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 
816 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1269  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 
1113 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.172811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 
394 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 
533 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0803  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 
1008 aa  44.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.462233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0920  glycoside hydrolase family 38  30 
 
 
1009 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 
823 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  28.93 
 
 
1025 aa  43.9  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  26.58 
 
 
1049 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  29.73 
 
 
457 aa  43.9  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  25.56 
 
 
1037 aa  43.9  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  28.83 
 
 
457 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>