32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1309 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  100 
 
 		 457 aa  939    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  80.92 
 
 		 456 aa  789    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  79.52 
 
 		 457 aa  755    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  86.43 
 
 		 457 aa  841    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  53.25 
 
 		 518 aa  395  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  45.97 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  45.69 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  41.63 
 
 		 484 aa  318  9e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  46.25 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  41.67 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  41.88 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  41.37 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  41.62 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  42 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  42.04 
 
 		 484 aa  296  6e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  41.58 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  38.31 
 
 		 447 aa  273  6e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  40 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  37.23 
 
 		 580 aa  271  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  37.16 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  36.23 
 
 		 487 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  34.43 
 
 		 416 aa  221  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  30.89 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  29.16 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  37.26 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  28.78 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  24.24 
 
 		 672 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  23.04 
 
 		 743 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  21.09 
 
 		 686 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  27.52 
 
 		 749 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  27.52 
 
 		 749 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 598 aa  43.9  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>