38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0601 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  81.08 
 
 		 407 aa  701    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  81.57 
 
 		 407 aa  702    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  100 
 
 		 407 aa  838    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  81.08 
 
 		 407 aa  699    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  62.47 
 
 		 580 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  49.25 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  47.76 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  46.21 
 
 		 495 aa  360  3e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  44.82 
 
 		 518 aa  352  7e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  43.84 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  43.07 
 
 		 397 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  40.79 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  42.13 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  41.67 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  40.71 
 
 		 456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  41.24 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  40.51 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  39.81 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  40.58 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  39.8 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  37.41 
 
 		 487 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  37.4 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  31.5 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  31.07 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  32.64 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  20.77 
 
 		 749 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  20.77 
 
 		 749 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 1162 aa  53.1  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  20.59 
 
 		 747 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  20.48 
 
 		 744 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  24.01 
 
 		 674 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  20.55 
 
 		 743 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  24.42 
 
 		 1006 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 		 1000 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  21.95 
 
 		 731 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 994 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  18.98 
 
 		 744 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>