26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0436 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
376 aa  779    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  49.87 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  31.44 
 
 
400 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  30.33 
 
 
484 aa  176  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  37.06 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  27.64 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  34.97 
 
 
407 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  30.84 
 
 
495 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  33.99 
 
 
407 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  35.48 
 
 
407 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  33.66 
 
 
407 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  31.77 
 
 
484 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  36.07 
 
 
580 aa  149  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  30.82 
 
 
444 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  34.11 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  32.19 
 
 
457 aa  140  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  30.71 
 
 
416 aa  133  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  30.31 
 
 
456 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  37.26 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  28.37 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  31.21 
 
 
490 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  34.01 
 
 
457 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  32.61 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  27.5 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  32.31 
 
 
448 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  29.37 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>