30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0985 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  100 
 
 		 416 aa  867    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  45.22 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  43.41 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  40.24 
 
 		 487 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  42.67 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  39.18 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  39.8 
 
 		 407 aa  295  8e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  38.54 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  38.54 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  38.54 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  36.49 
 
 		 518 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  37.84 
 
 		 495 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  37.08 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  36.25 
 
 		 484 aa  262  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  35.6 
 
 		 580 aa  256  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  35.4 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  34.61 
 
 		 484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  36.16 
 
 		 447 aa  242  7e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  36.02 
 
 		 444 aa  242  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  34.79 
 
 		 456 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  34.43 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  33.17 
 
 		 395 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  36.39 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  28.46 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  27.32 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  17.96 
 
 		 747 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  25.78 
 
 		 706 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  16.87 
 
 		 749 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  16.87 
 
 		 749 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>