35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1039 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  81.88 
 
 		 456 aa  773    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  79.52 
 
 		 457 aa  755    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  100 
 
 		 457 aa  931    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  80.62 
 
 		 457 aa  768    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  53.13 
 
 		 518 aa  402  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  46.28 
 
 		 495 aa  345  8e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  46.13 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  47.94 
 
 		 484 aa  332  8e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  44.68 
 
 		 398 aa  316  7e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  44.5 
 
 		 448 aa  315  8e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  41.88 
 
 		 407 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  42.13 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  41.12 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  41.62 
 
 		 407 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  42.08 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  41.7 
 
 		 444 aa  295  8e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  38 
 
 		 580 aa  290  4e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  39.82 
 
 		 447 aa  280  3e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  39.8 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  38.61 
 
 		 428 aa  269  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  37.08 
 
 		 416 aa  253  7e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  37.16 
 
 		 487 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  31.9 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  28.71 
 
 		 490 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 		 376 aa  140  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  28.28 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  21.76 
 
 		 672 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  28.38 
 
 		 749 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  28.38 
 
 		 749 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  24.26 
 
 		 743 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 580 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 744 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 		 1162 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  24.3 
 
 		 744 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 732 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>