51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1107 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  67.3 
 
 		 584 aa  771    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 580 aa  1187    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  57.32 
 
 		 577 aa  628  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  53.83 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  51.14 
 
 		 566 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  49.66 
 
 		 580 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  49.65 
 
 		 574 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  46.62 
 
 		 575 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  49.19 
 
 		 568 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  49.19 
 
 		 568 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  48.15 
 
 		 566 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  45.75 
 
 		 582 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  43.52 
 
 		 551 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  38.48 
 
 		 728 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  37.34 
 
 		 729 aa  343  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  38.79 
 
 		 729 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  38.3 
 
 		 728 aa  339  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  36.44 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 		 734 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  37.57 
 
 		 731 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  36.36 
 
 		 726 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  31.59 
 
 		 674 aa  316  6e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  35.94 
 
 		 726 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  37.79 
 
 		 722 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  35.89 
 
 		 726 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  35.73 
 
 		 695 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  33.39 
 
 		 759 aa  299  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  32.16 
 
 		 749 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  32.16 
 
 		 749 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  30.43 
 
 		 1042 aa  296  8e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  32.49 
 
 		 747 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  34.1 
 
 		 744 aa  286  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 		 744 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  30.2 
 
 		 829 aa  281  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  34.89 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  30.04 
 
 		 1162 aa  264  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 1006 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.66 
 
 		 994 aa  178  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 1000 aa  172  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 1022 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 1187 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  25.15 
 
 		 902 aa  56.2  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 606 aa  54.7  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  27.75 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 		 811 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  25 
 
 		 457 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  23.25 
 
 		 518 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  22.12 
 
 		 407 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  20.45 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  28.83 
 
 		 812 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>