64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0027 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  58.37 
 
 		 729 aa  883    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  60.08 
 
 		 732 aa  938    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 731 aa  1506    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  68.67 
 
 		 729 aa  1077    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  53.92 
 
 		 728 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  61.09 
 
 		 734 aa  936    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  54.61 
 
 		 728 aa  799    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  39.12 
 
 		 695 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  36.03 
 
 		 674 aa  478  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  37.2 
 
 		 726 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  37.14 
 
 		 726 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  36.71 
 
 		 726 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  38.43 
 
 		 759 aa  436  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  36.01 
 
 		 1042 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 		 722 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  35.51 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  34.02 
 
 		 747 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  36.17 
 
 		 749 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  35.63 
 
 		 744 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  36.02 
 
 		 749 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 744 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  35.4 
 
 		 743 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  37.9 
 
 		 582 aa  363  6e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  38.5 
 
 		 566 aa  349  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  38.93 
 
 		 577 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  35.84 
 
 		 566 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  38.26 
 
 		 568 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  38.26 
 
 		 568 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  37.17 
 
 		 580 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 575 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 1162 aa  324  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  36.78 
 
 		 574 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  37.46 
 
 		 584 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  37.57 
 
 		 580 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  36.46 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 551 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 1022 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 1000 aa  239  1e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 1006 aa  236  9e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  29.72 
 
 		 994 aa  220  7e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  26.04 
 
 		 902 aa  91.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 1187 aa  74.7  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 606 aa  57.8  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 935 aa  55.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 485 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 811 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  26.45 
 
 		 766 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 471 aa  49.7  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 533 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 813 aa  48.5  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 		 811 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 		 472 aa  47  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 485 aa  47  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 529 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 		 791 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1854  glycoside hydrolase family protein  25.87 
 
 		 582 aa  45.8  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  24.38 
 
 		 682 aa  45.8  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  21.95 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 		 807 aa  44.3  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  26.96 
 
 		 531 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  26.96 
 
 		 531 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 531 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2919  glycoside hydrolase family 57  28.48 
 
 		 512 aa  43.9  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>