54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2350 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  50.26 
 
 
794 aa  793    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  50.37 
 
 
811 aa  817    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  50.12 
 
 
811 aa  809    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  51.49 
 
 
813 aa  837    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 
786 aa  701    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  48.58 
 
 
814 aa  796    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  50.68 
 
 
812 aa  851    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  51.17 
 
 
817 aa  819    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
807 aa  1668    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  51.29 
 
 
820 aa  858    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  48.46 
 
 
814 aa  786    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  42.1 
 
 
850 aa  717    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  52.79 
 
 
811 aa  872    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  51.24 
 
 
807 aa  849    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  41.68 
 
 
823 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  42.52 
 
 
791 aa  592  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  43.82 
 
 
900 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  39.21 
 
 
862 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  39.05 
 
 
871 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  39.85 
 
 
816 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  39.34 
 
 
812 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  39.87 
 
 
812 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  40.8 
 
 
907 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  40 
 
 
902 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  36.24 
 
 
790 aa  466  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  46.22 
 
 
709 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  43.83 
 
 
779 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  43.98 
 
 
821 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  43.46 
 
 
771 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  40.52 
 
 
766 aa  362  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  37.74 
 
 
682 aa  313  9e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 
485 aa  259  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  36.48 
 
 
485 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 
472 aa  253  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  35.37 
 
 
471 aa  249  1e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 
609 aa  63.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  24.23 
 
 
706 aa  57.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  22.87 
 
 
520 aa  54.3  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  28.97 
 
 
686 aa  53.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  40.68 
 
 
542 aa  49.3  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 
1162 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  24.63 
 
 
728 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  46.51 
 
 
529 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 
582 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  24.17 
 
 
747 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  38.71 
 
 
529 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  21.88 
 
 
539 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  21.88 
 
 
539 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  19.12 
 
 
1042 aa  44.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 
731 aa  44.3  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  32.88 
 
 
527 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  23.5 
 
 
744 aa  44.3  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  24.14 
 
 
728 aa  44.3  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 
1022 aa  44.3  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>