64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0960 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  67.3 
 
 
580 aa  795    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
584 aa  1188    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  55.91 
 
 
577 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  50.51 
 
 
570 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  50.94 
 
 
580 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  49.66 
 
 
566 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  48.88 
 
 
574 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  48.52 
 
 
566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  48.85 
 
 
568 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  48.85 
 
 
568 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  45.49 
 
 
575 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  46.11 
 
 
582 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  42.61 
 
 
551 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 
732 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  38.68 
 
 
729 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  38.43 
 
 
728 aa  346  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  38.12 
 
 
728 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  37.18 
 
 
734 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  37.43 
 
 
729 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  37.46 
 
 
731 aa  339  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  38.29 
 
 
726 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  38.85 
 
 
726 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  37.94 
 
 
726 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  31.45 
 
 
674 aa  329  8e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  33.78 
 
 
747 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  31.27 
 
 
1042 aa  313  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  37.45 
 
 
695 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  33.16 
 
 
749 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  32.99 
 
 
749 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  37.81 
 
 
722 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  33.63 
 
 
744 aa  301  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 
759 aa  299  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 
744 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  29.15 
 
 
829 aa  274  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  34.43 
 
 
743 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 
1162 aa  270  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 
994 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
1006 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 
1000 aa  184  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 
1022 aa  182  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 
1187 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 
811 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 
786 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  21.53 
 
 
529 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  26.76 
 
 
794 aa  50.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0588  hypothetical protein  25.5 
 
 
538 aa  50.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 
871 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  32.71 
 
 
513 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  22.59 
 
 
542 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  21.46 
 
 
902 aa  48.5  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 
811 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 
511 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  33.7 
 
 
813 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  29.38 
 
 
814 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  20 
 
 
534 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.12 
 
 
935 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  30.08 
 
 
814 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  26.44 
 
 
771 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  21.54 
 
 
527 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 
820 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  51.28 
 
 
811 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  22.76 
 
 
606 aa  43.9  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  19.38 
 
 
528 aa  43.5  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>