47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2060 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 574 aa  1184    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  54.96 
 
 		 575 aa  657    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  51.38 
 
 		 580 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  52.6 
 
 		 577 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  49.65 
 
 		 580 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  48.5 
 
 		 570 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  48.19 
 
 		 566 aa  525  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  47.84 
 
 		 582 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  48.01 
 
 		 584 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  46.89 
 
 		 566 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  46.01 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  46.01 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  44.46 
 
 		 551 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  38.3 
 
 		 732 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  37.89 
 
 		 726 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  37.89 
 
 		 726 aa  346  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  38.46 
 
 		 728 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 		 726 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  35.21 
 
 		 729 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  37.26 
 
 		 728 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  35.97 
 
 		 734 aa  323  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  36.78 
 
 		 731 aa  322  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  35.48 
 
 		 729 aa  321  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 		 722 aa  319  9e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  31.61 
 
 		 674 aa  313  6.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  37 
 
 		 695 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  33.96 
 
 		 744 aa  304  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 		 744 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  31.87 
 
 		 1042 aa  297  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  33.79 
 
 		 749 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  33.62 
 
 		 749 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  34.07 
 
 		 747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 		 759 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  34.38 
 
 		 743 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  30.4 
 
 		 829 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 1162 aa  240  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 994 aa  187  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 1006 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 		 1000 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 1022 aa  147  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 1187 aa  67.4  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  23.88 
 
 		 606 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  25.15 
 
 		 902 aa  57.4  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  27.98 
 
 		 807 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  23.08 
 
 		 534 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 		 813 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>