48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1528 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
580 aa  1192    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  57.63 
 
 
577 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  51.38 
 
 
574 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  50.52 
 
 
570 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  49.66 
 
 
580 aa  544  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  48.1 
 
 
575 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  50.77 
 
 
584 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  48.17 
 
 
566 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  47.62 
 
 
582 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  46.07 
 
 
568 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  46.07 
 
 
568 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  45.6 
 
 
566 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  42.68 
 
 
551 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 
732 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  38.08 
 
 
729 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  33.99 
 
 
674 aa  347  5e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  37.9 
 
 
728 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  37.68 
 
 
728 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  36.91 
 
 
729 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 
734 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  37.17 
 
 
731 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  34.45 
 
 
744 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 
744 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  34.03 
 
 
747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  33.22 
 
 
749 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  36.88 
 
 
695 aa  303  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  33.04 
 
 
749 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  32.69 
 
 
759 aa  296  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  33.04 
 
 
726 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 
726 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  33.04 
 
 
726 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  30.09 
 
 
1042 aa  286  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  35.33 
 
 
743 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  35.35 
 
 
722 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  30.49 
 
 
829 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 
1162 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 
994 aa  197  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 
1000 aa  184  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 
1006 aa  183  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
1022 aa  171  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  24.18 
 
 
902 aa  70.9  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 
1187 aa  66.6  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 
606 aa  58.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 
472 aa  47  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  24.35 
 
 
534 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 
485 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  24.51 
 
 
811 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>