50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0408 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  60.79 
 
 
729 aa  921    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  55.82 
 
 
728 aa  821    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  56.37 
 
 
728 aa  827    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  62.04 
 
 
734 aa  957    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
729 aa  1504    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  61.85 
 
 
732 aa  952    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  68.67 
 
 
731 aa  1077    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  40.25 
 
 
695 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  35.99 
 
 
674 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  38.2 
 
 
726 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  38.07 
 
 
726 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 
726 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  39.49 
 
 
759 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  36.36 
 
 
744 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  34.98 
 
 
749 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  34.85 
 
 
749 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  34.28 
 
 
1042 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  36.28 
 
 
744 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  36.82 
 
 
722 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  34.46 
 
 
747 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  35.53 
 
 
743 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  32.58 
 
 
829 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  40.21 
 
 
582 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  40 
 
 
568 aa  356  8.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  40 
 
 
568 aa  356  8.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  37.43 
 
 
566 aa  355  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 
566 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  37.52 
 
 
577 aa  350  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  38.08 
 
 
580 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 
570 aa  347  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  36.4 
 
 
575 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  35.21 
 
 
574 aa  342  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  38.79 
 
 
580 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 
584 aa  332  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 
1162 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  35.73 
 
 
551 aa  323  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 
1022 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  32.1 
 
 
1006 aa  246  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
1000 aa  243  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 
994 aa  236  9e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  24.53 
 
 
902 aa  92  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 
1187 aa  73.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 
609 aa  70.5  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 
606 aa  54.7  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  23.04 
 
 
428 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 
485 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  25 
 
 
682 aa  44.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  22.67 
 
 
766 aa  44.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  25.76 
 
 
472 aa  44.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 
485 aa  44.3  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>