54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3177 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  58.88 
 
 		 728 aa  868    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  61.09 
 
 		 731 aa  936    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  67.71 
 
 		 732 aa  1021    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  62.04 
 
 		 729 aa  957    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 734 aa  1503    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  58.33 
 
 		 728 aa  862    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  75.89 
 
 		 729 aa  1139    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  40.08 
 
 		 695 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  36.26 
 
 		 674 aa  486  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  37.64 
 
 		 1042 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  37.99 
 
 		 726 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  37.99 
 
 		 726 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  38.26 
 
 		 726 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  39.72 
 
 		 759 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  37.7 
 
 		 829 aa  432  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  37.32 
 
 		 722 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  34.62 
 
 		 744 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  33.85 
 
 		 749 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  37.33 
 
 		 749 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  37.85 
 
 		 747 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 		 744 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  33.99 
 
 		 743 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  38.78 
 
 		 582 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  39.89 
 
 		 577 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  38.42 
 
 		 566 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  37.04 
 
 		 566 aa  346  7e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  38.98 
 
 		 568 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  38.98 
 
 		 568 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 		 580 aa  333  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 570 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  36.63 
 
 		 580 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  37.48 
 
 		 584 aa  325  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  35.97 
 
 		 574 aa  323  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  35.15 
 
 		 1162 aa  321  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  36.53 
 
 		 551 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 		 1006 aa  258  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 		 1000 aa  251  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  31.88 
 
 		 1022 aa  249  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 		 994 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  25.98 
 
 		 902 aa  97.4  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 609 aa  74.3  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 1187 aa  73.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  24.09 
 
 		 428 aa  53.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  24.67 
 
 		 766 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 813 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  24.36 
 
 		 706 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  22.94 
 
 		 495 aa  45.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  26.76 
 
 		 542 aa  45.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  25.76 
 
 		 812 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 816 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 811 aa  44.3  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 811 aa  43.9  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>