48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0509 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  54.96 
 
 		 574 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 575 aa  1203    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  51.57 
 
 		 577 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  48.1 
 
 		 580 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  46.43 
 
 		 570 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  46.55 
 
 		 566 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  46.62 
 
 		 580 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  47.25 
 
 		 582 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  45.49 
 
 		 584 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  45.57 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  46.26 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  46.26 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  41.55 
 
 		 551 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  38.8 
 
 		 728 aa  363  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  37.65 
 
 		 732 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  38.21 
 
 		 728 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  35.29 
 
 		 674 aa  346  5e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  36.4 
 
 		 729 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 		 734 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  35.38 
 
 		 726 aa  339  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  35.2 
 
 		 726 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  35.87 
 
 		 726 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 731 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  35.2 
 
 		 729 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 722 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 759 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  35.63 
 
 		 747 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  34.2 
 
 		 749 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  34.02 
 
 		 749 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  33.22 
 
 		 1042 aa  306  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  34.27 
 
 		 744 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  34.11 
 
 		 695 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  34.15 
 
 		 744 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  31.97 
 
 		 829 aa  279  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  34.56 
 
 		 743 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 1162 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  27.79 
 
 		 994 aa  193  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 1006 aa  184  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 1000 aa  179  9e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 		 1022 aa  161  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 		 609 aa  67.8  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 1187 aa  67  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  24.79 
 
 		 902 aa  53.9  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 606 aa  53.9  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  22.77 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  22.93 
 
 		 513 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  22.5 
 
 		 794 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  25 
 
 		 814 aa  45.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>