44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0777 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
566 aa  1177    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  50.73 
 
 
577 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  51.14 
 
 
580 aa  560  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  48.33 
 
 
570 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 
584 aa  534  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  46.55 
 
 
575 aa  528  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  48.19 
 
 
574 aa  525  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  48.36 
 
 
568 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  48.36 
 
 
568 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  48.17 
 
 
580 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  43.54 
 
 
551 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 
566 aa  463  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  44.12 
 
 
582 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  37.43 
 
 
729 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  37.3 
 
 
728 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  37.3 
 
 
728 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  37.75 
 
 
732 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 
734 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  36.9 
 
 
729 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 
731 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  34.44 
 
 
674 aa  323  5e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  35.28 
 
 
759 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  35.45 
 
 
726 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 
726 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  35.27 
 
 
726 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 
722 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  32.2 
 
 
1042 aa  301  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  34.61 
 
 
747 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  36.04 
 
 
695 aa  297  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  32.31 
 
 
829 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  34.48 
 
 
744 aa  294  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  33.39 
 
 
744 aa  289  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  33.22 
 
 
749 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  33.22 
 
 
749 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 
1162 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  34.27 
 
 
743 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 
1022 aa  172  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 
1006 aa  170  6e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 
1000 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 
994 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 
609 aa  68.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
606 aa  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 
1187 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  24.16 
 
 
902 aa  56.6  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>