46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1432 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
570 aa  1183    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  56.23 
 
 
577 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  53.83 
 
 
580 aa  587  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  50.52 
 
 
580 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  49.38 
 
 
566 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  50.34 
 
 
584 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  48.33 
 
 
566 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  46.43 
 
 
575 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  48.5 
 
 
574 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  46.13 
 
 
582 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  46.99 
 
 
568 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  46.99 
 
 
568 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 
551 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  37.63 
 
 
729 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  36.69 
 
 
728 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  36.69 
 
 
728 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 
734 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  35.06 
 
 
729 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  35.06 
 
 
1042 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  35.04 
 
 
749 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  34.87 
 
 
749 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  36.46 
 
 
731 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 
732 aa  317  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  31.82 
 
 
674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  35.56 
 
 
726 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  35.39 
 
 
726 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  34.57 
 
 
747 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  35.21 
 
 
726 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  35.95 
 
 
695 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  33.39 
 
 
744 aa  303  8.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  34.82 
 
 
722 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  31.89 
 
 
759 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 
744 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  35.34 
 
 
743 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  31.15 
 
 
829 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 
1162 aa  243  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 
1000 aa  184  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 
994 aa  180  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 
1006 aa  172  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 
1022 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.54 
 
 
1187 aa  60.5  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  20.5 
 
 
902 aa  54.7  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 
606 aa  53.9  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 
813 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 
786 aa  43.5  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>