53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3401 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  95.33 
 
 		 728 aa  1398    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 		 728 aa  1484    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  56.37 
 
 		 729 aa  846    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  61.18 
 
 		 732 aa  937    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  53.92 
 
 		 731 aa  808    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  58.88 
 
 		 734 aa  877    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  59.39 
 
 		 729 aa  877    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  40.31 
 
 		 695 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  39.18 
 
 		 674 aa  488  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  40.39 
 
 		 726 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  40.53 
 
 		 726 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  37.58 
 
 		 1042 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  39.97 
 
 		 726 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  40.76 
 
 		 759 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  39.06 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  36.2 
 
 		 829 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  36.93 
 
 		 744 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  37.09 
 
 		 744 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  37.17 
 
 		 747 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  40.78 
 
 		 582 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  37.76 
 
 		 743 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  36.55 
 
 		 749 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  36.7 
 
 		 749 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  40.87 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  38.12 
 
 		 566 aa  359  9e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  37.3 
 
 		 566 aa  353  5e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  39.53 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  37.26 
 
 		 574 aa  350  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  39.53 
 
 		 568 aa  350  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  38.48 
 
 		 580 aa  348  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 551 aa  346  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  38.26 
 
 		 580 aa  345  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 		 570 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  38.2 
 
 		 584 aa  328  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 1162 aa  324  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 		 1022 aa  256  9e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  31.14 
 
 		 994 aa  253  8.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 1000 aa  251  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  32.55 
 
 		 1006 aa  249  9e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  24.7 
 
 		 902 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 1187 aa  77.8  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 609 aa  69.3  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  21.09 
 
 		 606 aa  50.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 		 811 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  25.31 
 
 		 814 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 471 aa  47.8  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  26.02 
 
 		 794 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  25.31 
 
 		 814 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 807 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 820 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 485 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  28.48 
 
 		 521 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>