46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2957 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  100 
 
 
695 aa  1394    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  40.03 
 
 
732 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  40.75 
 
 
729 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  39.06 
 
 
731 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 
734 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  40.64 
 
 
728 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  40.64 
 
 
728 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  40.3 
 
 
729 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  33.43 
 
 
674 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  38.09 
 
 
726 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  38.22 
 
 
726 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  37.95 
 
 
726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  36.64 
 
 
744 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 
744 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  36.12 
 
 
759 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  33.18 
 
 
829 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  33.75 
 
 
1042 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  37.42 
 
 
747 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  37.99 
 
 
743 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  36.64 
 
 
749 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  36.75 
 
 
722 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  36.48 
 
 
749 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  40.62 
 
 
577 aa  343  8e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  39.38 
 
 
568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  39.38 
 
 
568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 
551 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  38.11 
 
 
566 aa  320  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  37.94 
 
 
582 aa  318  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  37 
 
 
574 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  35.73 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  35.95 
 
 
570 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  36.88 
 
 
580 aa  303  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  37.27 
 
 
584 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  36.04 
 
 
566 aa  297  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 
575 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 
1162 aa  291  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 
1022 aa  259  9e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 
1000 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  29.4 
 
 
1006 aa  211  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 
994 aa  204  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  24.77 
 
 
902 aa  74.7  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
1187 aa  68.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 
606 aa  67.4  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 
609 aa  57.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 
394 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  25.54 
 
 
407 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>