66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0856 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  67.71 
 
 		 734 aa  1021    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  61.59 
 
 		 728 aa  928    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  60.08 
 
 		 731 aa  938    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  61.18 
 
 		 728 aa  924    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 732 aa  1508    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  61.85 
 
 		 729 aa  952    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  67.21 
 
 		 729 aa  998    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  40.27 
 
 		 695 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  36.67 
 
 		 674 aa  491  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  38.64 
 
 		 726 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  38.99 
 
 		 726 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  38.55 
 
 		 726 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  37.85 
 
 		 1042 aa  468  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  37.06 
 
 		 759 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  38.59 
 
 		 722 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  36.32 
 
 		 829 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  35.73 
 
 		 744 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  35.64 
 
 		 749 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  41.83 
 
 		 582 aa  412  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  35.49 
 
 		 749 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  36.01 
 
 		 747 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  36.12 
 
 		 744 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  35.76 
 
 		 743 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  38.43 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  38.3 
 
 		 574 aa  366  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  37.65 
 
 		 575 aa  362  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  38.19 
 
 		 580 aa  356  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  39.68 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  39.68 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  37.75 
 
 		 566 aa  352  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  36.8 
 
 		 566 aa  342  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  36.44 
 
 		 580 aa  335  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 		 584 aa  332  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  36.62 
 
 		 551 aa  328  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  33.28 
 
 		 1162 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 570 aa  317  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 		 1022 aa  279  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  33.05 
 
 		 1006 aa  272  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 		 1000 aa  261  4e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 994 aa  260  6e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  25.76 
 
 		 902 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 		 609 aa  73.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 		 1187 aa  72.8  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  24.23 
 
 		 766 aa  60.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 811 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 811 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  23.31 
 
 		 495 aa  51.6  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  26.02 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 		 485 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  31.41 
 
 		 794 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 485 aa  48.5  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 817 aa  47.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  25.99 
 
 		 807 aa  47.4  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 		 791 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 820 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 811 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  25.48 
 
 		 428 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  31.25 
 
 		 814 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 471 aa  45.8  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 813 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  29.73 
 
 		 812 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 472 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 786 aa  44.7  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  27.17 
 
 		 457 aa  43.9  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  31.25 
 
 		 814 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>