49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3268 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  59.64 
 
 
794 aa  957    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  48.19 
 
 
807 aa  768    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  52.22 
 
 
814 aa  862    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  52.66 
 
 
812 aa  855    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  52.35 
 
 
814 aa  874    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  42.99 
 
 
786 aa  671    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  50.37 
 
 
813 aa  800    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  52.15 
 
 
811 aa  796    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  50.95 
 
 
811 aa  787    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
817 aa  1684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  51.17 
 
 
807 aa  819    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  51.42 
 
 
820 aa  806    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  51.74 
 
 
811 aa  858    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  41.65 
 
 
850 aa  685    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 
823 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  45.98 
 
 
900 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  41.76 
 
 
812 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  42.51 
 
 
812 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  42.63 
 
 
816 aa  612  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  40.05 
 
 
862 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  41.08 
 
 
871 aa  591  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  41.74 
 
 
907 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  42.14 
 
 
791 aa  559  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  37.63 
 
 
902 aa  552  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  41.87 
 
 
790 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  47.82 
 
 
779 aa  452  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  49.11 
 
 
709 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  45.7 
 
 
821 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  47.05 
 
 
771 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  39.23 
 
 
766 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  36.6 
 
 
682 aa  301  3e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  37.74 
 
 
485 aa  261  3e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 
471 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 
485 aa  253  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  38.8 
 
 
472 aa  253  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 
609 aa  64.3  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  26.59 
 
 
706 aa  61.6  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 
1162 aa  59.3  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  19.4 
 
 
1042 aa  50.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  27.1 
 
 
902 aa  48.1  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 
732 aa  47.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 
994 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  24 
 
 
686 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 
726 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  22.22 
 
 
744 aa  45.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  25.44 
 
 
726 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  22.51 
 
 
744 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  25.44 
 
 
726 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  22.11 
 
 
674 aa  44.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>