60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1264 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  43.84 
 
 
807 aa  636    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  45.81 
 
 
811 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  45.92 
 
 
811 aa  659    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
791 aa  1576    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  43.92 
 
 
813 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  42.05 
 
 
811 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  43.46 
 
 
812 aa  616  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  42.05 
 
 
807 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  42.04 
 
 
820 aa  586  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 
850 aa  582  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  42.14 
 
 
817 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  39.35 
 
 
814 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  42.91 
 
 
794 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  40.5 
 
 
814 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 
786 aa  557  1e-157  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  42.44 
 
 
871 aa  501  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  49.03 
 
 
790 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  48.82 
 
 
823 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  44.89 
 
 
900 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  49.22 
 
 
816 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  48.04 
 
 
812 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  48.63 
 
 
812 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  44.08 
 
 
862 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  42.17 
 
 
907 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  47.52 
 
 
709 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  42.96 
 
 
902 aa  426  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  42.76 
 
 
779 aa  399  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  45.86 
 
 
821 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  38.03 
 
 
766 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  43.95 
 
 
771 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  38.63 
 
 
682 aa  325  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 
485 aa  242  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  36.29 
 
 
485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 
472 aa  239  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  35.58 
 
 
471 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
609 aa  64.3  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  24.91 
 
 
749 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  24.91 
 
 
749 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.17 
 
 
935 aa  51.2  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  31.11 
 
 
537 aa  50.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  24.23 
 
 
747 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
1000 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.04 
 
 
1162 aa  49.3  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  20.16 
 
 
706 aa  48.9  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 
1006 aa  48.5  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  22.92 
 
 
744 aa  48.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  29.95 
 
 
726 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  26.26 
 
 
686 aa  47.8  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  29.95 
 
 
726 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
1058 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  24.57 
 
 
539 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  24.57 
 
 
539 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
732 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
731 aa  46.2  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  31.93 
 
 
528 aa  45.8  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  22.89 
 
 
744 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  24.23 
 
 
532 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  22.97 
 
 
524 aa  45.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  24.79 
 
 
1040 aa  44.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4461  hypothetical protein  33.33 
 
 
649 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.608634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>