43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0133 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  52.47 
 
 		 794 aa  858    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  46.74 
 
 		 813 aa  790    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  48.68 
 
 		 811 aa  808    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 		 786 aa  684    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  49.06 
 
 		 811 aa  808    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 		 814 aa  1702    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  50.06 
 
 		 812 aa  847    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  95.33 
 
 		 814 aa  1591    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  52.35 
 
 		 817 aa  885    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  48.58 
 
 		 807 aa  803    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  50.26 
 
 		 820 aa  811    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  42.7 
 
 		 850 aa  700    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  51.18 
 
 		 811 aa  881    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  45.1 
 
 		 807 aa  757    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  40.4 
 
 		 823 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  44.02 
 
 		 900 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  43.6 
 
 		 812 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  40.44 
 
 		 812 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  39.33 
 
 		 862 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  40.33 
 
 		 816 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  38.58 
 
 		 871 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  39.35 
 
 		 791 aa  560  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  40.41 
 
 		 907 aa  549  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  39.81 
 
 		 902 aa  545  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  38.64 
 
 		 790 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  48.41 
 
 		 709 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 779 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  44.47 
 
 		 771 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  43.95 
 
 		 821 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  40.07 
 
 		 766 aa  392  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  39.04 
 
 		 682 aa  308  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  36.97 
 
 		 485 aa  277  5e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 		 485 aa  269  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 471 aa  267  7e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  36.32 
 
 		 472 aa  259  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 		 609 aa  64.7  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  28.57 
 
 		 706 aa  56.2  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 		 1162 aa  54.3  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  25 
 
 		 686 aa  51.6  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  30.47 
 
 		 728 aa  48.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  25.31 
 
 		 728 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 732 aa  44.3  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>