61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0199 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
485 aa  987    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  77.73 
 
 
485 aa  783    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  74.31 
 
 
472 aa  757    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  78.37 
 
 
471 aa  767    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  38.85 
 
 
812 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  38.97 
 
 
811 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  38.97 
 
 
811 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  39.91 
 
 
813 aa  287  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
811 aa  284  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  38.56 
 
 
820 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  38.23 
 
 
807 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  36.97 
 
 
814 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  36.91 
 
 
814 aa  273  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  39.46 
 
 
709 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  37.74 
 
 
817 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
871 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 
786 aa  259  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  41.28 
 
 
779 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  35.11 
 
 
807 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  34.75 
 
 
790 aa  257  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 
823 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  36.46 
 
 
821 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  37.25 
 
 
771 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  38.3 
 
 
794 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 
791 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 
850 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  36.92 
 
 
812 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  37.36 
 
 
816 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  36.8 
 
 
812 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  33.98 
 
 
900 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  33.05 
 
 
862 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  36.72 
 
 
682 aa  229  8e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  33.11 
 
 
766 aa  226  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 
907 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  33.74 
 
 
902 aa  209  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 
1162 aa  76.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 
1006 aa  63.5  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 
994 aa  63.9  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 
1000 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
1022 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  28.48 
 
 
902 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  25.56 
 
 
706 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 
606 aa  54.7  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 
609 aa  53.5  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 
731 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  29.77 
 
 
726 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  29.77 
 
 
726 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 
726 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  25.14 
 
 
674 aa  50.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 
732 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
722 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  26.32 
 
 
728 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  25.56 
 
 
729 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  27.78 
 
 
729 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  26.44 
 
 
686 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 
394 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  26.27 
 
 
577 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  25.56 
 
 
728 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  28.57 
 
 
542 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 
734 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1919  4-alpha-glucanotransferase  26.29 
 
 
736 aa  43.5  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.666088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>