65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1330 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
528 aa  1097    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1356  hypothetical protein  98.48 
 
 
528 aa  1084    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000931698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  63 
 
 
534 aa  713    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  63.95 
 
 
533 aa  706    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0588  hypothetical protein  54.43 
 
 
538 aa  625  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2006  Domain of unknown function DUF1957  52.17 
 
 
528 aa  554  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  51.41 
 
 
531 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  51.41 
 
 
531 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  51.22 
 
 
531 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  51.04 
 
 
532 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  51.35 
 
 
513 aa  535  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0045  glycoside hydrolase family protein  48.95 
 
 
527 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  50.1 
 
 
536 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1889  hypothetical protein  47.62 
 
 
531 aa  514  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.804439 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  48.01 
 
 
537 aa  511  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  48 
 
 
529 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2325  glycoside hydrolase family protein  49.14 
 
 
537 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  48 
 
 
539 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  48 
 
 
539 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  47.94 
 
 
542 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0382  glycoside hydrolase family protein  48.58 
 
 
529 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3806  hypothetical protein  47.24 
 
 
529 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1983  hypothetical protein  48.95 
 
 
529 aa  488  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  46.05 
 
 
529 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0306  hypothetical protein  45.47 
 
 
528 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  45.56 
 
 
528 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  44.4 
 
 
524 aa  455  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0429  hypothetical protein  46.79 
 
 
528 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  42.08 
 
 
935 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1854  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 
582 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 
533 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  37.92 
 
 
521 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1940  hypothetical protein  35.93 
 
 
531 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0726  hypothetical protein  36.69 
 
 
527 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0687  hypothetical protein  37.55 
 
 
521 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.034103  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11251  hypothetical protein  36.07 
 
 
520 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.448443  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  35.8 
 
 
527 aa  339  7e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  36.31 
 
 
527 aa  339  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1076  hypothetical protein  36.98 
 
 
527 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09171  hypothetical protein  35.63 
 
 
522 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127848 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  37.02 
 
 
527 aa  329  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  35.06 
 
 
520 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1094  hypothetical protein  29.6 
 
 
525 aa  259  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  31.67 
 
 
514 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4461  hypothetical protein  31.39 
 
 
649 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.608634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6057  glycoside hydrolase family 57  28.38 
 
 
499 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 
521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 
521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  25.97 
 
 
520 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3262  hypothetical protein  25.47 
 
 
522 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13047  hypothetical protein  25.18 
 
 
526 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4261  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
531 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2097  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 
532 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28290  hypothetical protein  26.71 
 
 
505 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.964818  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2919  glycoside hydrolase family 57  26.8 
 
 
512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4653  glycoside hydrolase family 57  24.75 
 
 
491 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0114  hypothetical protein  25.74 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.54756  normal  0.147271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4743  hypothetical protein  23.64 
 
 
478 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  28.47 
 
 
361 aa  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  19.73 
 
 
749 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  19.73 
 
 
749 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  24.85 
 
 
674 aa  44.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  20.86 
 
 
1162 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>