65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1045 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2325  glycoside hydrolase family protein  60.61 
 
 
537 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
529 aa  1103    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0429  hypothetical protein  65.9 
 
 
528 aa  694    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  61.17 
 
 
528 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  62.21 
 
 
536 aa  721    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  56.87 
 
 
542 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  57.71 
 
 
531 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  57.71 
 
 
531 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  57.71 
 
 
531 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2006  Domain of unknown function DUF1957  52.65 
 
 
528 aa  611  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  55.62 
 
 
532 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  50.85 
 
 
537 aa  584  1.0000000000000001e-165  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0045  glycoside hydrolase family protein  53.6 
 
 
527 aa  578  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  52.56 
 
 
539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  52.56 
 
 
539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  53.22 
 
 
529 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1889  hypothetical protein  52.84 
 
 
531 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.804439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3806  hypothetical protein  53.03 
 
 
529 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0382  glycoside hydrolase family protein  53.41 
 
 
529 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  52.47 
 
 
935 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1983  hypothetical protein  52.46 
 
 
529 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  50.66 
 
 
533 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  48.16 
 
 
513 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1854  glycoside hydrolase family protein  50.09 
 
 
582 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  46.9 
 
 
533 aa  495  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0588  hypothetical protein  45.56 
 
 
538 aa  498  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  45.97 
 
 
534 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0306  hypothetical protein  45.99 
 
 
528 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  47.25 
 
 
524 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  46.05 
 
 
528 aa  481  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1356  hypothetical protein  46.05 
 
 
528 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000931698  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0687  hypothetical protein  41.39 
 
 
521 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.034103  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1940  hypothetical protein  41.11 
 
 
531 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  41.5 
 
 
521 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0726  hypothetical protein  40.78 
 
 
527 aa  359  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  40.72 
 
 
527 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  38.64 
 
 
527 aa  340  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1076  hypothetical protein  38.09 
 
 
527 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  37.69 
 
 
527 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09171  hypothetical protein  40.56 
 
 
522 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127848 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11251  hypothetical protein  38.49 
 
 
520 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.448443  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  32.6 
 
 
520 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1094  hypothetical protein  28.74 
 
 
525 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  33.7 
 
 
514 aa  253  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4461  hypothetical protein  32.31 
 
 
649 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.608634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  31.13 
 
 
520 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6057  glycoside hydrolase family 57  31.23 
 
 
499 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3262  hypothetical protein  29.12 
 
 
522 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 
521 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 
521 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2919  glycoside hydrolase family 57  28.12 
 
 
512 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  29.67 
 
 
521 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28290  hypothetical protein  29 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.964818  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2097  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 
532 aa  170  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4261  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 
531 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13047  hypothetical protein  26.93 
 
 
526 aa  160  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0114  hypothetical protein  27.22 
 
 
480 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.54756  normal  0.147271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4743  hypothetical protein  26.48 
 
 
478 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4653  glycoside hydrolase family 57  27.87 
 
 
491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  27.74 
 
 
361 aa  57.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 
1162 aa  54.3  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  46.51 
 
 
807 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 
731 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  22.95 
 
 
722 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>