60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6057 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6057  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 		 499 aa  980    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28290  hypothetical protein  71.49 
 
 		 505 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.964818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2919  glycoside hydrolase family 57  60.63 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2097  glycoside hydrolase family protein  58.3 
 
 		 532 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  57.92 
 
 		 521 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13047  hypothetical protein  57.47 
 
 		 526 aa  545  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  57.92 
 
 		 521 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  57.92 
 
 		 521 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4261  glycoside hydrolase family protein  56.41 
 
 		 531 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3262  hypothetical protein  58.96 
 
 		 522 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  31.35 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  34.54 
 
 		 514 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1854  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  29.25 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.8 
 
 		 935 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  30.4 
 
 		 539 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  30.4 
 
 		 539 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2006  Domain of unknown function DUF1957  29.71 
 
 		 528 aa  206  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1940  hypothetical protein  32.73 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2325  glycoside hydrolase family protein  31.78 
 
 		 537 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3806  hypothetical protein  30.78 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0588  hypothetical protein  27.58 
 
 		 538 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  29.64 
 
 		 536 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  27.72 
 
 		 533 aa  204  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0687  hypothetical protein  27.6 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.034103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0045  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 527 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  26.74 
 
 		 534 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  27.6 
 
 		 521 aa  200  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1889  hypothetical protein  31.05 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.804439 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  27.36 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0726  hypothetical protein  31.53 
 
 		 527 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 		 529 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  29.9 
 
 		 529 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1983  hypothetical protein  28.52 
 
 		 529 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  31.42 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0382  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 529 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0429  hypothetical protein  31.2 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  28.96 
 
 		 537 aa  190  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  26.13 
 
 		 527 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  30.71 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 		 531 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 528 aa  187  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  30.98 
 
 		 533 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  30.71 
 
 		 531 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09171  hypothetical protein  32.4 
 
 		 522 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127848 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  26.89 
 
 		 527 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  26.76 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1356  hypothetical protein  28.98 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000931698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 528 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0306  hypothetical protein  27.47 
 
 		 528 aa  183  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  26.3 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1076  hypothetical protein  27.16 
 
 		 527 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11251  hypothetical protein  27.24 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.448443  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4461  hypothetical protein  30.43 
 
 		 649 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.608634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4653  glycoside hydrolase family 57  35.28 
 
 		 491 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  29.38 
 
 		 520 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4743  hypothetical protein  25.97 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0114  hypothetical protein  26.94 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.54756  normal  0.147271 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1094  hypothetical protein  22.49 
 
 		 525 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>