62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1094 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1094  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1082    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  30.48 
 
 
524 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0588  hypothetical protein  30.55 
 
 
538 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0306  hypothetical protein  29.31 
 
 
528 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 
528 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
529 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  29.01 
 
 
532 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  28.76 
 
 
531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  29.03 
 
 
534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1356  hypothetical protein  29.41 
 
 
528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000931698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  28.76 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  28.33 
 
 
533 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.6 
 
 
935 aa  243  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2325  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 
537 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  27.1 
 
 
537 aa  243  7.999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  27.53 
 
 
529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  28.33 
 
 
536 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  27.95 
 
 
542 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2006  Domain of unknown function DUF1957  27.29 
 
 
528 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
528 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1889  hypothetical protein  26.96 
 
 
531 aa  238  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.804439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0045  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 
527 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 
533 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3806  hypothetical protein  26.39 
 
 
529 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1854  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 
582 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  25.14 
 
 
539 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  26.4 
 
 
513 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0429  hypothetical protein  27.06 
 
 
528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  25.38 
 
 
539 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0382  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 
529 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1983  hypothetical protein  26.24 
 
 
529 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  28.57 
 
 
521 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0687  hypothetical protein  27.36 
 
 
521 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.034103  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0726  hypothetical protein  26.63 
 
 
527 aa  190  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11251  hypothetical protein  27.89 
 
 
520 aa  190  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.448443  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1940  hypothetical protein  26.87 
 
 
531 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  28.14 
 
 
527 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  26.05 
 
 
527 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1076  hypothetical protein  26.42 
 
 
527 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09171  hypothetical protein  26.95 
 
 
522 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127848 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  26.2 
 
 
527 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  24.91 
 
 
514 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  24.21 
 
 
520 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0114  hypothetical protein  21.66 
 
 
480 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.54756  normal  0.147271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 
511 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  23.4 
 
 
520 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6057  glycoside hydrolase family 57  22.49 
 
 
499 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2097  glycoside hydrolase family protein  22.16 
 
 
532 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28290  hypothetical protein  23.31 
 
 
505 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.964818  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4743  hypothetical protein  23.15 
 
 
478 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4461  hypothetical protein  29.82 
 
 
649 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.608634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2919  glycoside hydrolase family 57  24.09 
 
 
512 aa  84  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3262  hypothetical protein  21.19 
 
 
522 aa  84  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4261  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 
531 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13047  hypothetical protein  20.91 
 
 
526 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  21 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  21 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  21 
 
 
521 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4653  glycoside hydrolase family 57  23.59 
 
 
491 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
1000 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
823 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>