62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13047 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1848  glycoside hydrolase family protein  81.89 
 
 
521 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3262  hypothetical protein  67.12 
 
 
522 aa  672    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4261  glycoside hydrolase family protein  80.58 
 
 
531 aa  850    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13047  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1059    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2097  glycoside hydrolase family protein  81.96 
 
 
532 aa  857    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1914  glycoside hydrolase family protein  81.89 
 
 
521 aa  862    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0322006  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2919  glycoside hydrolase family 57  64.22 
 
 
512 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1868  glycoside hydrolase family protein  81.89 
 
 
521 aa  862    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28290  hypothetical protein  57.95 
 
 
505 aa  547  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.964818  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6057  glycoside hydrolase family 57  57.47 
 
 
499 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0895  glycoside hydrolase family 57  29.62 
 
 
520 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  26.61 
 
 
542 aa  196  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1854  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 
582 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.85 
 
 
935 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  31.23 
 
 
514 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0801  hypothetical protein  28.04 
 
 
536 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79707  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0560  glycoside hydrolase family 57  26.09 
 
 
513 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  29.6 
 
 
531 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  29.89 
 
 
531 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0687  hypothetical protein  27.42 
 
 
521 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.034103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 
531 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1940  hypothetical protein  28.71 
 
 
531 aa  179  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2006  Domain of unknown function DUF1957  25.64 
 
 
528 aa  179  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  26.84 
 
 
521 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2325  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 
537 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0867  hypothetical protein  26.89 
 
 
533 aa  176  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0429  hypothetical protein  28.16 
 
 
528 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0726  hypothetical protein  29.38 
 
 
527 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1115  hypothetical protein  29.75 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.096996  normal  0.0392314 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0047  hypothetical protein  26.04 
 
 
537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.666843  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1889  hypothetical protein  27.34 
 
 
531 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.804439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0099  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 
533 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0588  hypothetical protein  24.95 
 
 
538 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1330  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
528 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00276943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1356  hypothetical protein  24.82 
 
 
528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000931698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4461  hypothetical protein  28.96 
 
 
649 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.608634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5064  hypothetical protein  26.07 
 
 
529 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1915  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 
528 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0191786  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0339  hypothetical protein  24.78 
 
 
534 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0382  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 
529 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11251  hypothetical protein  26.92 
 
 
520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.448443  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0045  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 
527 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3806  hypothetical protein  26.87 
 
 
529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1332  hypothetical protein  27.18 
 
 
539 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1304  hypothetical protein  26.99 
 
 
539 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0306  hypothetical protein  26.84 
 
 
528 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1045  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 
529 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0294  hypothetical protein  25.4 
 
 
524 aa  160  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1983  hypothetical protein  26.53 
 
 
529 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4653  glycoside hydrolase family 57  31.27 
 
 
491 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  24.5 
 
 
527 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09171  hypothetical protein  28.57 
 
 
522 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127848 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1076  hypothetical protein  25.15 
 
 
527 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  24.31 
 
 
527 aa  153  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1501  hypothetical protein  28.63 
 
 
520 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.53215  normal  0.500126 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  23.67 
 
 
527 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3734  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0114  hypothetical protein  28.66 
 
 
480 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.54756  normal  0.147271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4743  hypothetical protein  25.72 
 
 
478 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1094  hypothetical protein  20.91 
 
 
525 aa  81.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 
609 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 
1162 aa  43.5  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>