51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1295 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  40.5 
 
 
820 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
871 aa  1801    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  41.61 
 
 
812 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  42.04 
 
 
813 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  40.45 
 
 
811 aa  605  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  41.08 
 
 
817 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  41.99 
 
 
811 aa  592  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  42.03 
 
 
811 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  38.58 
 
 
814 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  40.15 
 
 
807 aa  579  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  39.05 
 
 
807 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  38.7 
 
 
814 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  36.97 
 
 
850 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  41.14 
 
 
794 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  41.18 
 
 
900 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  36.58 
 
 
786 aa  538  1e-151  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  38.07 
 
 
816 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  39.17 
 
 
812 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  40.96 
 
 
812 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  49.61 
 
 
791 aa  509  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  37.1 
 
 
862 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 
823 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  36.26 
 
 
902 aa  509  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  35.67 
 
 
907 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  36.48 
 
 
790 aa  474  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  45.66 
 
 
709 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  40.93 
 
 
766 aa  395  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  41.83 
 
 
779 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  42.25 
 
 
771 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  41.95 
 
 
821 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  34.69 
 
 
682 aa  305  3.0000000000000004e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  35.78 
 
 
485 aa  257  7e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  35.73 
 
 
485 aa  257  8e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 
472 aa  254  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 
471 aa  251  3e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 
1162 aa  67.8  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  25.62 
 
 
744 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 
744 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  23.48 
 
 
749 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  23.48 
 
 
749 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  27.1 
 
 
686 aa  52.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 
584 aa  52  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
726 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  28.57 
 
 
726 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  28.76 
 
 
726 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  24.9 
 
 
747 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  40.3 
 
 
542 aa  48.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 
570 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 
722 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 
1000 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  23.64 
 
 
728 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>