40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0769 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  56.82 
 
 		 821 aa  831    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  51.46 
 
 		 771 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 779 aa  1563    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  46.28 
 
 		 709 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  47.82 
 
 		 817 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 811 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 811 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  42.04 
 
 		 807 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  45.71 
 
 		 814 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 		 811 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  42.47 
 
 		 786 aa  434  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  45.25 
 
 		 814 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  43.56 
 
 		 820 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  44.74 
 
 		 812 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  43.83 
 
 		 807 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 		 850 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  43.95 
 
 		 813 aa  416  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  42.76 
 
 		 791 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  46.11 
 
 		 794 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  41.87 
 
 		 790 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  41.83 
 
 		 871 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  41.51 
 
 		 823 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  37.24 
 
 		 766 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  42.26 
 
 		 816 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  34.25 
 
 		 900 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  41.89 
 
 		 812 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  39.35 
 
 		 862 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  41.17 
 
 		 812 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  36.78 
 
 		 902 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 907 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  33.08 
 
 		 682 aa  266  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  38.11 
 
 		 485 aa  263  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 485 aa  249  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 		 471 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  35.49 
 
 		 472 aa  241  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 609 aa  55.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  19.85 
 
 		 706 aa  53.9  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  21.58 
 
 		 686 aa  51.2  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  24.38 
 
 		 747 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 		 566 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>