45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3241 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  100 
 
 
709 aa  1454    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  46.28 
 
 
779 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  55.28 
 
 
821 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  54.51 
 
 
771 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  47.44 
 
 
820 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  48.52 
 
 
811 aa  469  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  47.63 
 
 
811 aa  465  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 
811 aa  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  48.41 
 
 
814 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  46.64 
 
 
813 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  49.11 
 
 
817 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  46.46 
 
 
786 aa  444  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  47.61 
 
 
814 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  45.84 
 
 
807 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  46.22 
 
 
807 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  46.51 
 
 
812 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  47.52 
 
 
791 aa  431  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  47.24 
 
 
794 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  43.56 
 
 
850 aa  415  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  45.66 
 
 
871 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  44.77 
 
 
790 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  45.02 
 
 
900 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  41.18 
 
 
862 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  42.47 
 
 
812 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  41.01 
 
 
823 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  42.47 
 
 
816 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  41.7 
 
 
812 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  43.13 
 
 
902 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  43.1 
 
 
907 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  39.31 
 
 
766 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  38.03 
 
 
682 aa  300  5e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  39.46 
 
 
485 aa  269  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  37.98 
 
 
485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  37.66 
 
 
471 aa  256  8e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  38.43 
 
 
472 aa  253  8.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  21.34 
 
 
706 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
1162 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 
609 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 
566 aa  50.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  26.42 
 
 
686 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1076  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 
531 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  22.46 
 
 
747 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 
722 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1135  hypothetical protein  24.1 
 
 
531 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1204  hypothetical protein  24.1 
 
 
531 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.117287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>