42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0553 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  43.69 
 
 
807 aa  752    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  44.69 
 
 
813 aa  751    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  44.23 
 
 
811 aa  711    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  44.28 
 
 
811 aa  720    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  44.5 
 
 
812 aa  738    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  42.7 
 
 
814 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  42.09 
 
 
814 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  41.65 
 
 
817 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  42.1 
 
 
807 aa  717    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  43.91 
 
 
820 aa  714    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
850 aa  1781    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  44.58 
 
 
811 aa  738    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  41.1 
 
 
794 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 
786 aa  635  1e-180  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 
791 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  36.97 
 
 
871 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  40.84 
 
 
900 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  36.52 
 
 
862 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  39.41 
 
 
823 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  35.15 
 
 
812 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  35.19 
 
 
812 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  37.55 
 
 
907 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  38.59 
 
 
816 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  35.49 
 
 
902 aa  502  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  34.36 
 
 
790 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  43.56 
 
 
709 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 
779 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  39.26 
 
 
771 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  40.22 
 
 
821 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  39.31 
 
 
766 aa  365  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  34.9 
 
 
682 aa  283  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 
472 aa  250  8e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 
485 aa  245  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
471 aa  244  7e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 
485 aa  241  4e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
609 aa  61.2  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 
1162 aa  48.9  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  25 
 
 
706 aa  48.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  26.97 
 
 
728 aa  45.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  25 
 
 
749 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  25 
 
 
749 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  25.81 
 
 
686 aa  45.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>